Ciao,
in futuro potrebbe essere possibile aggiungere il supporto ad altri DBMS, ma al momento non è una priorità poiché effettivamente di ridotta utilità pratica. MySQL è infatti disponibile in moltissime distribuzioni per i diversi sistemi operativi, e pertanto molto comune. Inoltre, anche se non indicato esplicitamente, il gestionale dovrebbe funzionare anche con dei relativi fork di MySQL, come MariaSB per esempio.
Per l'archiviazione dei PDF in un altro filesystem, ti consiglierei di considerare una personalizzazione.
E' infatti in definizione un sistema di gestione degli allegati con molteplici servizi, ma non sarà disponibile nel breve periodo.