La stessa operazione può essere effettuata con Adobe Acrobar Reader: selezioni più PDF e con il tasto destro selezioni l'opzione Stampa. In questo modo dovrebbe partire in automatico la stampa di tutti i file.
Purtroppo in ogni caso non si tratta di una funzionalità sviluppabile a breve, e in generale è un problema del sistema operativo in utilizzo e dei programmi di stampa.