il file VERSION c'è sempre e contiene il numero di versione attuale. il file VERSION.old viene creato al momento di un aggiornamento o installazione e contiene il numero precedente di versione da cui partire con l'aggiornamento. per l'installazione viene scritto il numero più basso di versione che è la 0.2 e qualcosa...
così su due piedi non mi viene in mente altro da farti provare, se hai un accesso remoto (vnc, desktop remoto) possiamo sentirci in privato e provare a risolvere