Ciao, avevi provato a togliere il commento dalla riga 27 del file config.inc.php
per vedere se riesci ad impostarlo direttamente da lì?

In alternativa dovresti intervenire sul file my.cnf
aggiungendo questi valori
[mysqld]
sort_buffer_size = 2M
Comunque che io sappia questa mancata impostazione non genera problemi di installazione dei moduli, Potesti controllare dentro la cartella logs
del gestionale e farci avere qualche dettaglio in più dell'errore riscontrato?