Potresti provare ad eseguire la seguente query, e vedere se l'errore persiste?
UPDATE `zz_modules` SET `options` = '{ "main_query": [ { "type": "table", "fields": "Ragione sociale, Tipologia, Città, Telefono, color_Rel.", "query": "SELECT `idanagrafica` AS `id`, ragione_sociale AS `Ragione sociale`, (SELECT GROUP_CONCAT(descrizione SEPARATOR '', '') FROM an_tipianagrafiche INNER JOIN an_tipianagrafiche_anagrafiche ON an_tipianagrafiche.idtipoanagrafica=an_tipianagrafiche_anagrafiche.idtipoanagrafica GROUP BY idanagrafica HAVING idanagrafica=an_anagrafiche.idanagrafica) AS `Tipologia`, citta AS `Città`, telefono AS `Telefono`, an_relazioni.colore AS `color_Rel.`, an_relazioni.descrizione AS `color_title_Rel.`, deleted FROM an_anagrafiche LEFT OUTER JOIN an_relazioni ON an_anagrafiche.idrelazione=an_relazioni.id HAVING 1=1 AND deleted=0 ORDER BY `ragione_sociale`"} ]}' WHERE `name` = 'Anagrafiche';
Mi pare però strano che si verifichi un errore simile, dato che apparentemente gli aggiornamenti dovrebbero essere andati a buon fine...
A proposito, hai modificato il file di configurazione my.ini per eliminare la modalità strict di MySQL?
PS: sarebbe consigliabile che cambiassi le credenziali, se corrispondono a username root e password admin, poiché erano visibili da un'errore iniziale sul file mysql.log.
SELECT *, (SELECT nome FROM zz_gruppi WHERE id=idgruppo) AS gruppo FROM zz_utenti WHERE username="root" AND password=MD5("admin")